Высокоспецифичные зонды для количественной ПЦР содержат конформационно-блокированные LNA модификации, повышающие эффективность ПЦР-РВ особенно в случае AT-богатых последовательностей и анализа точечных мутаций. LNA модификации формируют фиксированную конформацию сахарного фрагмента, образованного метиленовым мостиком между атомом кислорода в 2'-положении и углеродом в 4'-положении сахара. Фиксированная конформация рибозы улучшает эффективность гибридизации с мишенью, даже если в олигонуклеотиде есть только 3-5 LNA модификаций. Зонды для ПЦР-РВ могут содержать до 6 LNA нуклеотидов для повышения стабильности дуплекса с ДНК-мишенью. Высокоспецифичные зонды для количественной ПЦР могут быть оптимальным выбором для определения однонуклеотидного полиморфизма (SNP) или других сложных задач, требующих повышенной селективности.
Повышенная чувствительность и точность количественной ПЦР
Больше возможностей применения за счет использования коротких зондов
Рекомендованные пары Флуорофор-Гаситель для HiAffinity зондов
* Для внутренних модификаций – Гасители и флуорофоры вводятся только через dT. Свяжитесь с нами, если Вы не нашли желаемой модификации. Узнайте больше о модификациях здесь.
**GTQ гасители – полные химические аналоги BHQ™ гасителей Свяжитесь с нами, если Вы не нашли желаемой модификации.
Флуорофор
Гаситель**
FAM
TAMRA
GTQ1
R6G
SIMA
HEX
R6G
GTQ2
VIC
JOE
HEX
ROX
Cy5
Cy5.5
Cy5.5
GTQ3
0
LNA модификации формируют фиксированную конформацию сахарного фрагмента, образованного метиленовым мостиком между атомом кислорода в 2'-положении и углеродом в 4'-положении сахара. Фиксированная конформация рибозы улучшает эффективность гибридизации с мишенью, даже если в олигонуклеотиде есть только 3-5 LNA модификаций. LNA модификация определяет идеальную конформацию для образования Уотсона-Криковских связей (см. модификации). Включение LNA значительно повышает температуру плавления, что позволяет делать зонды для количественной ПЦР короче по сравнению со стандартными. Более короткие зонды обладают повышенной селективностью, эффективностью тушения флуоресценции и выше соотношение сигнал/шум, кроме того, зонды с LNA эффективнее распознают мутации или однонуклеотидные полиморфизмы (SNP).
• Длина последовательности 5-40 нуклеотидов
• Допустимо до 6 LNA модификаций на зонд
• На 5'-конце возможны только нуклеотиды ДНК
• Широкий набор комбинаций Флуорофор-Гаситель
