Каталог

2’-дезоксиИнозин

2’-дезоксиинозин (dI) представляет собой встречающийся в природе нуклеотид, который образует стабильные комплементарные пары со всеми четырьмя дезоксинуклеотидами в ДНК дуплексах. Таким образом, инозин известен как «универсальное» или «нейтральное» основание. Стабильность комплементарных пар меняется в следующем порядке: dI:dC > dI:dA > dI:dG ~dI:dT. Встраивание инозина в последовательность праймера приводит к получению праймеров с «переменными» нуклеотидами. А именно включение dI в праймеры (так называемые вырожденные праймеры) позволяет одновременно амплифицировать гомологичные последовательности, например, близких штаммов, слабо консервативных участки и т. д. Показано,  что при использовании вырожденных праймеров в ПЦР с полимеразами, обладающими корректирующей активностью, происходит остановка ПЦР, так как полимераза не узнает неоднозначные пары оснований и диссоциирует с ДНК [T. Knittel et al, 1993], поэтому для работы с праймерами, содержащими dI мы рекомендуем использовать обычные Taq или Pfu ДНК-полимеразы.

Условное обозначение: dI

2'deoxyInosine- General Structure - рус.png

[1] DOI: 10.1101/gr.2.4.346