Дизайн и скрининг миРНК и АСО

Дизайн и скрининг миРНК и АСО

Антисмысловые олигонуклеотиды и малые интерфирирующие РНК (миРНК) - это лучший подход к эффективному нокдауну гена для изучения его функции in vitro и in vivo.

миРНК представляют собой короткие синтетические РНК олигонуклеотиды длиной от 17 до 27 нуклеотидов, способные ингибировать различные РНК в клетке. Природные миРНК нарезаются белком Dicer, а затем антисмысловая цепь загружается в белковый комплекс RISC для участия в защите от вирусов методом РНК-интерференции (RNAi). Белковый компонент Ago2 комплекса RISC представляет собой рибонуклеазу, которая расщепляет РНК, комплементарную антисмысловой цепи. Мы рекомендуем использовать химически модифицированную миРНК, чтобы снизить уровень деградации внутриклеточными нуклеазами и иммуногенности.

Антисмысловые олигонуклеотиды (АСО) представляют собой короткие олигонуклеотиды (15-25 оснований), комплементарные РНК-мишени и инициирующие её деградацию за счет разрезания РНКазой Н. На сегодняшний день антисмысловые олигонуклеотиды нашли и другие применения. Антисмысловые олигонуклеотиды используют в качестве переключателей сплайсинга, связываясь с мРНК-мишенью и изменяя её сплайсинг, блокируя взаимодействия пре-мРНК с мРНК-РНК и мРНК-белковыми компонентами сплайсинга. Также синтетические антисмысловые олигонуклеотиды используют как антагомиры, комплементарныe к микроРНК и блокирующие связывание микроРНК с мРНК-мишенями. Мы предлагаем химически-модифицировать АСО для улучшения эффективности нокдауна РНК-мишени, а также повышения  стабильности олигонуклеотида к нуклеазой, снижения иммунного ответа и улучшения фармакологических свойств. Например, введение нуклеотидов, содержащих 2'-O-метоксиэтил (2'-MOE), или Locked Nucleic Acid (LNA) нуклеотидов в химерный гапмерный АСО приводит к улучшению сродства к РНК-мишени.

 AO «ГенТерра» предоставляет услуги по дизайну с использованием собственного программного обеспечения и синтезу синтетических АСО/миРНК, а также анализу активности АСО/миРНК in vitro (эффективность ингибирования и определение IC50) и проведение начальных in vivo экспериментов в животных. По запросу мы также можем обеспечить отрицательным и положительным контролями миРНК. 

По всем вопросам и для обсуждения проекта обращайтесь info@genterra.ru.


11 Ген терра - (определение гена мишени...) (файл в векторе)ру.png